Le comité d’attribution des Soutiens à Projets Innovants et structurants (SaPIs) s’est réuni le vendredi 19 janvier de 13h à 17h et le lundi 22 janvier de 15h à 16h en visioconférence. Le comité était composé de Alexandre Dehne Garcia , Eric Maldonado, Jean-François Rey et Sandrine Sabatié , au titre de la Cellule d’Animation des Métiers du Numérique INRAE (DipSO), Hadi Quesneville (Directeur Adjoint DipSO, en charge du numérique), Stéphane Paris (Représentant DSI), Gaële Schoenacker (Représentante Pépinière Numérique) et Laurence Rouseau (Représentante externe, DSI CIRAD).

Neuf dossiers ont été soumis, pour un montant total de 126 400 € dont 87 200 € demandés pour 2024, 39 200 € pour 2025 et 0 € pour 2026. Sept dossiers ont été sélectionnés pour des montants financés de 40 300 € pour 2024 (soit un financement annuel de 62 950 € sur 2024, en tenant compte des engagements de l’édition précédente) et 19 200 € engagés pour 2025.

Le comité constate que le nombre de dossiers déposés est en diminution et toujours d’une grande diversité. Il note une part importante de sujets et actions déjà financés les précédentes années. Ces financements sont souvent apparus comme récurrents et présentant beaucoup moins les aspects innovants ou structurants qui font l’ADN des SaPIs. De plus, la commission a relevé, comme chaque année, que certains projets étaient à la frontière de l'animation scientifique et/ou de la formation et mériteraient d'être plutôt financés par les départements ou les infrastructures de recherche et/ou la Formation Tout au Long de La Vie (FTLV) de la DRH.

Le comité a évalué la qualité et l’impact portés par les dossiers. Il a soutenu particulièrement les projets structurant la communauté, ceux présentant clairement un travail collectif impliquant plusieurs CATI. Les dossiers ne présentant pas très clairement ces aspects n’ont pas été acceptés ou financés uniquement sur la partie structurante.

Espace Numérique d’échanges et de pratiques pour le TRAItement de Données Drones.

PORTEURS : Guiffant Nadia, Alleaume Samuel, De Boissieu Florian

CATI/PEPI : GEDEOP

COMPOSITION DE L’ÉQUIPE RESPONSABLE :

• Samuel ALLEAUME, IR, UMR TETIS
• Laurent BORGNIET, IR, UMR LESSEM
• Florian DE BOISSIEU, IR, UMR TETIS
• Fabien GUERRA, IE, UMR RECOVER
• Nadia GUIFFANT, AI, UMR TETIS
• Wilfried HEINTZ, IR, UMR Dynafor
• Audrey JOLIVOT, ingénieure, UMR TETIS
• Didier LE THIEC, DR, UMR SILVA
• Alexia MATHOU, IECN, UEFP
• Daniel MOURA, AI, UMR ITAP

TYPE DE PROJET : projet structurant

RÉSUMÉ DU PROJET :

Le projet vise à i) structurer la communauté INRAE des pilotes de drones et utilisateurs des données acquises, au travers d’animations techniques sous forme de séminaires et d’ateliers ; ii) co-construire des guides méthodologiques pour acquérir et traiter des données issues de drones ; iii) participer aux pratiques de gestion des données selon les principes FAIR et l’écosystème des services INRAE, notamment l’entrepôt institutionnel ; iv) poursuivre l’étude de faisabilité d’une plateforme commune de traitement sur la base des besoins identifiés et des produits existants.

PORTEURS : Martine Da Rocha

CATI/PEPI : BARIC, BIOS4Biol, BOOM, GREP, PlantBreed

COMPOSITION DE L’ÉQUIPE RESPONSABLE :

• F. Legeai, M. Da Rocha, N. Lapalu
• C. Hoede, G. Pascal, L. Jouneau
• H. Chiapello, C. Midoux, V. Loux
• J. Lagnel, Y. De Oliviera

TYPE DE PROJET : projet structurant

RÉSUMÉ DU PROJET :

La communauté des CATI omiques organise depuis 2019 un hackathon annuel. Ces événement ont permis une structuration forte de la communauté des ingénieurs en bioinformatique travaillant sur les données omiques, d'intégrer les nouveaux arrivants, mutualiser nos compétences et travailler ensemble sur des projets communs et innovants lorsque les thématiques sont partagées par nos CATI respectifs. L'objectif pour 2024 est d'organiser de nouveaux atelier pour la co-conception de solution innovants pour le traitement, l'analyse, l'intégration de donnés omiques.

PORTEURS : Marie-Hélène Moirez-Charron

CATI/PEPI : PEPI-2G, SCIPA, SoNET

COMPOSITION DE L’ÉQUIPE RESPONSABLE :

• Marie-Hélène Moirez-Charron
• Alexandre Journaux
• Sophie Normant
• Eric Maldonado

TYPE DE PROJET : projet structurant

RÉSUMÉ DU PROJET :

L’agilité est devenue depuis quelques années une méthode très pratiquée dans la gestion des projets informatiques. Nous souhaitons capitaliser les expériences et créer une communauté sur cette pratique au sein d’INRAE. Nous envisageons d’organiser un séminaire en 2025 pour échanger et se former à l’agilité. En 2024, nous construirons le programme en mobilisant des forces en interne compagnées par des experts de la méthode.

2024 et 2025

PORTEURS : LAPALU Nicolas

CATI/PEPI : BARIC, GREP, PlantBreed BIOS4Biol

COMPOSITION DE L’ÉQUIPE RESPONSABLE :

• LAPALU Nicolas
• Confais Johann
• Legeai Fabrice
• Lagnel Jacques
• Duvaux, Ludovic

TYPE DE PROJET : projet structurant

RÉSUMÉ DU PROJET :

Tester et implémenter des solutions pour produire, décrire et manipuler des graphes de pangénomes et les annotations associées (gènes et éléments transposables). Un attendu fort est de permettre l’intégration d’annotations issues d’outils complémentaires dans les approches pangénomiques (ex PanREPET pour les TE). Il s’agit de développer des services automatisés, pour stocker et décrire les données sources, déclencher automatiquement des traitements (workflows) par intégration continue. Le projet permettra de consolider un collectif qui a été initié dans des actions précédentes et souhaite se renforcer pour mutualiser son travail et monter en compétence.

2024 et 2025

PORTEURS : Brunaud Véronique

CATI/PEPI : SysMics, BOOM, BARIC

COMPOSITION DE L’ÉQUIPE RESPONSABLE :

• Véronique Brunaud
• Hélène Chiapello
• Fabrice Legeai

TYPE DE PROJET : projet structurant

RÉSUMÉ DU PROJET :

Le but du projet est de rassembler, partager et expertiser des jeux de données intégrant différents types de données “omiques” au sein de différents CATI, en impliquant des ingénieur·e·s de différentes équipes ayant des compétences complémentaires. La 1ère année, nous organiserons plusieurs réunions dont une en présentielle afin de définir les besoins, les critères et les modalités de sélection de jeux de données . Puis en 2nd année, nous recruterons un stagiaire de Master pendant 6 mois pour collecter, décrire et intégrer les données essentiellement en génomique, transcriptomique, métabolomique et protéomique.

PORTEURS :

CATI/PEPI :

COMPOSITION DE L’ÉQUIPE RESPONSABLE :

TYPE DE PROJET : projet structurant

RÉSUMÉ DU PROJET :

PORTEURS :

CATI/PEPI :

COMPOSITION DE L’ÉQUIPE RESPONSABLE :

TYPE DE PROJET : projet structurant

RÉSUMÉ DU PROJET :