Ceci est une ancienne révision du document !
SaPI 2026
Projet ADREvo
Description : Projet structurant d’animation de la communauté AgroDataRing (ADR)
PORTEURS :
Nicolas Lapalu
CATI/PEPI (porteur): BARIC
COMPOSITION DE L’ÉQUIPE RESPONSABLE :
- Nicolas Lapalu – CATI BARIC
- David Benaben – CATI PROSODIE / CATI SOBRE (4G)
- Véronique Brunaud - CATI SysMics / Modelix (4G)
TYPE DE PROJET : projet structurant d’animation de la communauté AgroDataRing (ADR)
RÉSUMÉ DU PROJET :
Depuis son lancement en 2018, le projet de stockage mutualisé AGRODATARING a continué son développement en accueillant de nouvelles unités partenaires (16 entités) atteignant maintenant un ensemble de 21 serveurs de stockages dit « locaux » pour une capacité totale de stockage d’environ 1.5 Po. Ces serveurs locaux sont actuellement répliqués sur une solution interne vieillissante basée sur GlusterFS et installée sur des serveurs hébergés sur le datacenter INRAE de Toulouse. Depuis plusieurs mois, en collaboration avec la DSI INRAE, un partenariat a été signé avec le Datacenter régional Occitanie (Drocc) ouest pour disposer d’espace de stockage de type objet d’une capacité évolutive et permettant d’accueillir les réplications. Le but de ce projet est d’apporter un soutien financier à un hackathon ayant pour but de finaliser le code de déploiement et les tests de robustesse de cette nouvelle couche de l’infrastructure ADR
Projet All4PanTEs
Description :
PORTEURS :
Johann Confais
CATI/PEPI (porteur): GIPSci
COMPOSITION DE L’ÉQUIPE RESPONSABLE :
- Confais Johann, GREP (3G) GIPSci (4G), johann.confais@inrae.fr
- Kreplak Jonathan, GREP (3G) GIPSci (4G), jonathan.kreplak@inrae.fr
- Elbelt Sonia, PlantBreed (3G) GIPSci (4G), sonia.elbelt@inrae.fr
- Lasserre-Zuber Pauline, BARIC, pauline.lasserre-zuber@inrae.fr
- Duvaux, Ludovic, BIOS4Biol, ludovic.duvaux@inrae.fr
TYPE DE PROJET :
RÉSUMÉ DU PROJET :
panREPET a été initialement développé pour annoter les éléments transposables dans les pangénomes, à partir de génomes modèles de petite taille. Aujourd’hui, plusieurs équipes d’INRAE travaillant sur des génomes de grande taille souhaitent l’exploiter, ce qui nécessite une adaptation de l’outil à la montée en charge. Le projet a ainsi pour objectif d’améliorer la robustesse, l’interopérabilité et les performances de panREPET ainsi que le développement d’outils de visualisation, d’une documentation complète et d’actions de formation pour la communauté
Projet ComparTax
Description : Évaluation de méthodes permettant la comparaison de bases de données taxonomiques et de séquences pour l’analyse d’écosystèmes microbiens
PORTEURS :
BERNARD Maria et RUÉ Olivier
CATI/PEPI (porteur): BIOS4Biol (→ B4B) ; OR : BOOM PEPI IBIS
COMPOSITION DE L’ÉQUIPE RESPONSABLE :
* Maria Bernard - CATI B4B - maria.bernard@inrae.fr * Olivier Rué - CATI BOOM - olivier.rue@inrae.fr * Maxime Courcelle - CATI BOOM - maxime.courcelle@inrae.fr * Joseph Tran - CATI BARIC - joseph.tran@inrae.fr * Kévin Gazengel - CATI BARIC - kevin.gazengel@inrae.fr * Samuel Mondy - CATI BARIC - samuel.mondy@inrae.fr * Géraldine Pascal - CATI B4B - geraldine.pascal@inrae.fr * Gabryelle Agoutin - CATI B4B - gabryelle.agoutin@inrae.fr * Lucas Auer - CATI B4B - lucas.auer@inrae.fr * Etienne Rifa - CATI B4B - etienne.rifa@inrae.fr * Benjamin Linard – UR MathNum - benjamin.linard@inrae.fr
TYPE DE PROJET : projet pilote (POC
RÉSUMÉ DU PROJET : La comparaison des études sur les écosystèmes microbiens se heurte aujourd'hui à un verrou majeur : l'hétérogénéité et l'instabilité des référentiels taxonomiques. Pour lever cet obstacle, le projet ComparTax vise à identifier et tester des méthodes de réconciliation capables de quantifier la convergence entre bases de données divergentes. En établissant un cadre d'évaluation normé et une méthodologie de test standardisée, ce projet fournira les bases nécessaires permettant d’avancer vers une véritable interopérabilité des études en écologie microbienne.
Projet IPFS
Description : Système distribué de fichiers pour les données de la recherche
PORTEURS :
Goby Cédric
Landrivon Emmanuel (CNRS)
CATI/PEPI (porteur): DevSecOps
COMPOSITION DE L’ÉQUIPE RESPONSABLE :
- Aurélien PERILLAT-BOTTONET - CATI DevSecOps
- Angélique ADIVEZE - CATI SIP
- Dr Geoffrey GOODELL - University College London
- Prof. Jean-Henry MORIN - Université de Genève
TYPE DE PROJET : POC
RÉSUMÉ DU PROJET :
Interplanetary File System (IPFS) est un système distribué de fichiers pair à pair qui ne dépend pas de serveurs centralisés. Son but est de connecter un ensemble d'équipements informatiques indépendants (appelés nœuds) avec le même système de fichiers. Ce projet de preuve de concept (PoC) vise à explorer et évaluer ce système pour les données de la recherche, notamment sa complémentarité avec la blockchain.
Projet POTE
Description : Projet d’évOlution des Technologies d’authEntification
PORTEURS :
Julien Cufi
CATI/PEPI (porteur): DIISCICO
COMPOSITION DE L’ÉQUIPE RESPONSABLE :
- CUFI Julien / DIISICO
- DERVAUX Stéphane / DIISICO
- BRUN Nicolas / INGELO
- GONZALEZ Denis / INGELO
- CLASTRE Philippe / GEDEOP
- GALLAVARDIN Antoine / DevSecOps
- OUATTARA ASSITA / INGELO
TYPE DE PROJET : Projet Structurant
RÉSUMÉ DU PROJET :
L’objectif du projet est de :
- faciliter l’utilisation du référentiel d’identité INRAE sur plusieurs SI scientifiques identifiés comme stratégiques par les départements
- faire remonter les besoins de ces SI en matière de fonctionnalités nécessaire pour la gestion des externes et des API interagissant avec le référentiel d’identité
- faire monter en compétence les ingénieurs des CATI hors DSI sur des techniques modernes de gestion des autorisations et de l’authentification.
- sensibiliser sur les implications liés à l'utilisation d'un référentiel Ad Hoc (Sécurité, Maintenance, Responsabilité…)
Projet RefProj’
Description : Réalisation d’un POC pour la création d’un référentiel de projets
PORTEURS :
Marion Massol
CATI/PEPI (porteur): INGELO
COMPOSITION DE L’ÉQUIPE RESPONSABLE :
- Amélie FIOCCA / CATI GEDEOP
- Murielle MARCHERAT
- Elodie VANDARD / SONET (3G) / INGELO (4G)
- François CEDELLE / CATI INGELO
- Julien CUFI / CATI DISCIICO
- Denis GONZALEZ / SONET (3G) / INGELO (4G)
- Christian PICHOT ./ CATI GEDEOP
TYPE DE PROJET : POC
RÉSUMÉ DU PROJET :
l est ressorti des journées e-infras 2025 qu’INRAE ne disposait pas d’un référentiel de projets qui soit complet et interopérable avec les SI stratégiques. Le projet « RefProj’ » a pour objectifs de 1. construire (POC) une première version d’un référentiel de ce type sur le périmètre des projets SI menés au sein des e-infrastructures INRAE, 2. interfacer ce référentiel avec au moins 1 SI stratégique et 3. mesurer l’impact pour les utilisateurs (ceux qui saisissent l’information + les utilisateurs étendus).
Projet Réseau SHINY ::INRAE
Description : Création et animation d’un réseau de la communauté des utilisateurs et utilisatrices R et Shiny dans l’institut et extérieur. Organisation d’une journée de conférence et de workshops.
PORTEURS :
Jean-François Rey
CATI/PEPI (porteur): DevSecOps&Cloud
COMPOSITION DE L’ÉQUIPE RESPONSABLE :
- David Carayon / CATI GEDEOP
- Cédric Midoux / CATI BOOM
- Elise Maigné / CATI B4B
- Marine Marjou / CATI IMOTEP
- Jean-François Rey / CATI DevSecOps&Cloud
- Isabelle Sanchez / CATI CODEX
- Joseph Tran / CATI BARIC
- Emily Walker / CATI IMOTEP
TYPE DE PROJET : projet structurant
RÉSUMÉ DU PROJET :
Le réseau SHINY::INRAE veut fédérer une communauté R-Shiny dans l’institut pour permettre : l’animation autour de cet environnement, le partage des expériences et la communication au sein de l’institut et extérieur.
Projet Seminar BioinfOmics
Description : Projet structurant de fédération autour des graphes de connaissances.
PORTEURS :
Rué olivier
CATI/PEPI (porteur): BOOM
COMPOSITION DE L’ÉQUIPE RESPONSABLE :
- Olivier Rué (CATI BOOM)
- Philippe Bordron (CATI B4B)
- Raphaël Flores (CATI GIPSci)
- Fabrice Legeai (CATI BARIC)
- Sandra Dérozier (CATI MODELIX)
- Anne Tireau (CATI CODEX)
- Virginie Rossard (CATI CODEX)
- Clément Frainay (CATI eMPrEInTE)
TYPE DE PROJET : projet structurant
RÉSUMÉ DU PROJET :
Le séminaire BioinfOmics vise à fédérer la communauté INRAE autour des graphes de connaissances qui constituent un levier structurant pour l’intégration, l’interopérabilité et la valorisation des données scientifiques. Il abordera les fondements et usages du web sémantique, des ontologies, des standards RDF et des bases de données orientées graphe (ie. Neo4j), au travers de retours d’expérience et de cas d’usage INRAE. Une action de mise en pratique (en cours de définition : datathon/hackathon) permettra d’expérimenter concrètement l’ingénierie de la connaissance sur des jeux de données réels, en lien avec les infrastructures et services existants.
Projet SGBDTimeSeries
Description : Évaluation de SGBD Time Series pour un Service Robuste de Gestion de Données Temporelles
PORTEURS :
Lafage Mathieu
Lagnel Jacques
Maldonado Eric
Langrume Christophe
Laperruque François Autres à venir
CATI/PEPI(porteur) : DevSecOps, GipSci, MICADO, DIISCICO, SICPAE
COMPOSITION DE L’ÉQUIPE RESPONSABLE :
- Lafage, Mathieu, DSI, DevSecOps
-Malsdonado Eric DSI, MICADO
- Lagnel, Jacques, BAP, GIPSci
- Langrume, Christophe, TRANSFORM, DIISCICO / Pépinière Numérique
- Catala, Pierre, DSI, DevSecOps
- Laperruque, François, GA, SICGPAE
TYPE DE PROJET : POC
RÉSUMÉ DU PROJET : Ce projet vise en premier lieu à une preuve de concept (POC) et vise à explorer et évaluer les systèmes de gestion de bases de données orientés séries temporelles (Time Series Database Management Systems – TSDB) dans le but de concevoir une offre de service structurée et robuste portée par la DSI. Les bases de données concernées incluent notamment InfluxDB, MongoDB (avec support des données temporelles), TimescaleDB, QuestDB, VictoriaMetrics, ainsi que d’autres solutions open source ou disposant d’un support commercial.
Projet WebSemPilot2
Description : Projet structurant d’animation d’une communauté
PORTEURS :
François Moreews
CATI/PEPI (porteur): CONNECT
COMPOSITION DE L’ÉQUIPE RESPONSABLE :
- François Moreews, CATI CONNECT
- Mateo Boudet, CATI BARIC
- Gwendal Virlet CATI SICGPAE
TYPE DE PROJET : projet structurant d’animation d’une communauté
RÉSUMÉ DU PROJET :
Le projet WebSemPilot2 a pour objectif de rassembler les initiatives de développement d’API et composants logiciels combinant graphe de connaissances (RDF, OWL, SPARQL, graphes de propriétés) et IA (LLM, RAG) au sein d'INRAE. Le projet organise un séminaire et un hackathon pour former les équipes INRAE et explorer des cas d’usage concrets, en lien avec l’École Thématique ETLMIC 2026 sur les modèles de langue et l’extraction de connaissances. Toutes les ressources (codes, tutoriels, documentation) seront centralisées sur la forge INRAE en open source, assurant leur réutilisation et pérennisation. L’objectif est de poursuivre la structuration d’une communauté interdisciplinaire (développeurs, scientifiques, experts IA) et de renforcer les partenariats entre acteurs académiques. WebSemPilot2 s’inscrit dans les objectifs stratégiques du plan données INRAE, notamment pour former aux nouvelles approches, améliorer l’interopérabilité et valoriser les données.