Le projet R4multidata a été officiellement ouvert le 28/01/2025.
Objectif : La communauté R4multidata vise à créer un environnement standardisé pour tester et comparer des fonctions de packages R avec des données réelles et simulées. Au départ, les packages RGCCA et mixOmics seront utilisés, avant de s’intéresser à d’autres packages. Quatre méthodes sont envisagées prioritairement : l’analyse canonique des correspondances régularisée généralisée sparse ou classique ((sparse)RGCCA) et la régression PLS sparse ou classique ((sparse)PLS).
Livrables :
- Un compte rendu des analyses et comparaison (méthodologie appliquée, résultats) avec des recommandations
- soit un webinaire ouvert à tous les membres de CATIs, soit des interventions dans des Assemblées Générales ou animations scientifiques de CATIs, équipes ou unités des agents ayant participé au projet.
- une communication via le forum de la DipSO, et lors des séminaires de cohésion CATI/PEPI/Pépinière.
- les jeux de données, scripts et dockers d’exécution qui auront servi au travail de comparaison, mis à disposition via un entrepôt de données (data.gouv.fr) sous licence, et la forge institutionnelle.
Phases du projet :
- préparation du travail de comparaison de fonctions de packages R (5 mois ⇒ janv – mai 25) : Théorie des méthodes; établissement des critères de comparaison, et du plan de comparaison pour prendre en compte différentes structures de données qui peuvent impacter les résultats; mise en place des outils collaboratifs de travail; préparation des jeux de données réelles et simulées
- travail de comparaison lors d’un hackathon (2 jours ⇒ mai 2025): programmation sous R, application aux données, synthèse des résultats obtenus.
- l’analyse et mise en forme des résultats (3 mois ⇒ juin - aout 25)
- la diffusion des résultats (3 mois ⇒ sept-nov 25)
Etat d'avancement :
préparation du travail de comparaison de fonctions de packages R
- outils collaboratifs mis en place: projet sur la forge institutionnelle, espaces collaboratifs de travail, tutoriels pour l'utilisation des outils
- jeux de données: les données de 3 projets ont été packagées et déposées sur la forge institutionnelle
travail de comparaison lors d’un hackathon
le hackathon s'est déroulé du 20 au 22 mai 2025 à Balma
l’analyse et mise en forme des résultats
les résultats sont accessibles sur le site internet du projet https://r4multidata.pages-forge.inrae.fr/r4manalysis/
la diffusion des résultats
en plus de la communication sur le site internet https://r4multidata.pages-forge.inrae.fr/r4manalysis/ , une présentation du projet et des résultats a eu/aura lieu:
- lors de l'AG du CATI codex (mars 2025)
- lors du séminaire interCATI/PEPI 2G (juin 2025)
- lors des journées du PEPI IBIS (octobre 2025)
- lors du congrès Chimiométrie (poster, février 2026)
- lors du séminaire interCATI/PEPI 2G (mai 2026)
- lors des journées de la SFdS (communication orale, juin 2026)
- lors du webinaire du PEPI 3G (juin 2026)
- lors des rencontres R (poster, juin 2026)