Le projet R4multidata a été officiellement ouvert le 28/01/2025.
Objectif :
La communauté R4multidata vise à créer un environnement standardisé pour tester et comparer des fonctions de packages R avec des données réelles et simulées. Au départ, les packages RGCCA et mixOmics seront utilisés, avant de s’intéresser à d’autres packages. Quatre méthodes sont envisagées prioritairement : l’analyse canonique des correspondances régularisée généralisée sparse ou classique ((sparse)RGCCA) et la régression PLS sparse ou classique ((sparse)PLS).
Livrables :
Un compte rendu des analyses et comparaison (méthodologie appliquée, résultats) avec des recommandations
soit un webinaire ouvert à tous les membres de CATIs, soit des interventions dans des Assemblées Générales ou animations scientifiques de CATIs, équipes ou unités des agents ayant participé au projet.
une communication via le forum de la DipSO, et lors des séminaires de cohésion CATI/PEPI/Pépinière.
les jeux de données, scripts et dockers d’exécution qui auront servi au travail de comparaison, mis à disposition via un entrepôt de données (data.gouv.fr) sous licence, et la forge institutionnelle.
Phases du projet :
préparation du travail de comparaison de fonctions de packages R (5 mois ⇒ janv – mai 25) : Théorie des méthodes; établissement des critères de comparaison, et du plan de comparaison pour prendre en compte différentes structures de données qui peuvent impacter les résultats; mise en place des outils collaboratifs de travail; préparation des jeux de données réelles et simulées
travail de comparaison lors d’un hackathon (2 jours ⇒ mai 2025): programmation sous R, application aux données, synthèse des résultats obtenus.
l’analyse et mise en forme des résultats (3 mois ⇒ juin - aout 25)
la diffusion des résultats (3 mois ⇒ sept-nov 25)
Etat d'avancement :
préparation du travail de comparaison de fonctions de packages R
outils collaboratifs mis en place: projet sur la forge institutionnelle, espaces collaboratifs de travail, tutoriels pour l'utilisation des outils
jeux de données: les données de 3 projets ont été packagées et déposées sur la forge institutionnelle
travail de comparaison lors d’un hackathon
le hackathon s'est déroulé du 20 au 22 mais 2025 à Balma
l’analyse et mise en forme des résultats
en cours
la diffusion des résultats
une présentation du projet a eu lieu:
lors de l'AG du CATI codex (mars 2025)
lors du séminaire interCATI/PEPI 2G (juin 2025)
lors des journées du PEPI IBIS (octobre 2025)
un site internet est en cours de finalisation pour la diffusion des résultats:https://r4multidata.pages-forge.inrae.fr/r4manalysis/