Les CATIs 3G

Vue d'ensemble des propositions de CATI-3G à la phase d'AMI. L'objectif était de situer ces propositions par rapport aux domaines du SDN. Pour le domaine de recherche, nous avons tenté d’aller plus loin en les situant dans un espace croisant 3 dimensions : l’“objet” d’étude, les échelles étudiées (des gènes aux agro-socio-écosystèmes et l’activité dominante sur un gradient données–modèles. L’objectif était aussi de voir les adhérences, interactions, chevauchements possibles à ces propositions. Pour cela, nous avons aussi proposé des clusters : Omics, Génétique et phénotypage, données des systèmes, modélisation des systèmes et “systems biology”. La figure composée de 2 losanges reliés par un trait représente des CATIs se situant sur plusieurs objets voire domaines non voisins sur le graphique.

Liste des CATIs

Acronyme	Nom Détaillé Porteur(s) Opérationnels(s)	Département(s)/DAR pilote(s)	Effectif 2019 - 2022
BARIC	Bioinformatique pour l’Analyse, la Représentation et Intégration de Connaissances	Bernhard GSCHOESSL, Fabrice LEGEAI (SPE)	[SPE], BAP, AGROECOSYSTEM	30→35
BIOS4Biol	Bio-informatique et Statistiques pour la Biologie / Bioinformatics Statistics for Biology	Luc JOUNEAU (SA), Géraldine PASCAL (Phase)	[MATHNUM , GA], ECODIV, BAP, TRANSFORM, PHASE, SA	34—>51
BOOM	Bioinformatics for Omics and metaOmics of Microbes	Hélène CHIAPELLO (MICA), Valentin LOUX (MATHNUM)	[MATHNUM, MICA], PHASE	29—>36
CITISES	Centre Informatisé du Traitement de l'Information en Sciences Économiques et Sociales	Annie HOFSTETTER, Jean-Marc ROUSSELLE (ECOSOCIO)	[ECOSOCIO], ALIMH	38
CODEX	COnnaissance et Données EXpérimentales	Eric LATRILLE (AGROECOSYSTEM), Sébastien ROUX (MATHNUM)	[MATHNUM, AGROECOSYSTEM], TRANSFORM, SPE, BAP, MICA, ALIMH	22—>28
CTIG	Centre de Traitement de l’Information Génétique	Marc Laval (GA)	[GA]	6—>16
DIISCICO	Développements Informatiques pour l’Instrumentation, le Suivi, le Contrôle et l’Intégration des Connaissances sur les prOcédés	Patrice BUCHE, Laurent BOUVIER (TRANSFORM)	TRANSFORM , MATHNUM, ACT, ALIMH, PHASE, ECODIV, AGROECOSYSTEM, SPE	41—>37
eMPrEInTE	Molecular PhEnotyping and bIochemical daTa Engineering	Franck GIACOMONI (ALIMH), David LEGLAND (TRANSFORM)	[ALIMH, TRANSFORM]	17—>29
GEDEOP	GEstion des Données d’Expérimentations, d’Observations et de Pratiques sur les agro-socio-éco-systèmes	Wilfried HEINTZ (ECODIV)	[ECODIV], ACT, AGROECOSYSTEM, AQUA, MATHNUM, SPE	66—>85
GREP	Genomics Research Environment for Plants	Michaël ALAUX & Raphaël FLORES (BAP)	[BAP], SPE, ECODIV	26—>22
IMOTEP	Information, Modèles et Traitement des données en Epidémiologie et dynamique de Populations	Thierry HOCH (SA), Hervé RICHARD (MATHNUM)	MATHNUM, SA, SPE, ECODIV, ALIMH	31—>46
IUMAN	Informatisation et Utilisation des Modèles pour les Agroécosystèmes Numériques	Patrick CHABRIER (MATHNUM)	[AGROECOSYSTEM, MATHNUM], ACT, ECODIV, Phase, ECOSOCIO, SPE, AQUA	51—>52
PlantBreed	Software Environment for Plant Selection	Alain CHARCOSSET, Yannick DE OLIVEIRA & Jacques LAGNEL (BAP)	[BAP]	18—>25
PROSODIe	Compilations Reproductibilité et Qualité pour l’Informatique Scientifique	Sophie AUBIN & Tovo RABEMANANTSOA (DipSO)	[MATHNUM, DipSO], BAP, DICSDAR, TRANSFORM, ALIMH, ECODIV, AGROECOSYSTEM, AQUA	19—>32
SICPA	Systèmes d'informations et calcul pour le phénotypage animal	François LAPERRUQUE (GA), Bernadette URBAN (Phase)	[GA, Phase]	28—>33
SIP	Services Informatiques de Proximité	Pactrick BERGER (TRANSFORM), Eddie IANNUCCELLI (DSI)	DSI et départements (ACT, AGROECOSYSTEM,ALIMH…)	~100—>99
SoNET	Socle numérique et expertises transverses	Olivier SCHNEIDER (DSI)	DSI, Diagonal, DRH, DICSDAR, DPCE, DPI, GEVES, DiFA	~150—>180
SysMics	Systems Biology for Omics	Sandra DÉROZIER & Marc DINH (MATHNUM), Johann JOETS (BAP)	[MATHNUM, BAP], MICA	18—>21

La commission d’homologation

Comme pour les deux premières campagnes d’homologation a été mise, une commission a été mise en place en 2017. L’objectif était notamment que cette troisième génération de Catis soit en mesure de servir les nouveaux enjeux du numérique. La commission a été construite avec la volonté d’incorporer des niveaux de compétences, de points de vue, et de responsabilités diversifiées dans les domaines de l’informatique scientifique et d’appui.

Sa composition était la suivante :

Laurent Bruckler, PC Occitanie-Montpellier, Président de la commission (participation à la commission Catis 2G 2012)

Michaël Chelle, Délégué scientifique à la Transition numérique

Christophe Caron, unité Ingenum, en charge du volet e-infrastructure

Hélène Chiapello, en charge des Pepis (et du lien avec Cati), de la formation et GPEC dans l’unité Ingenum, puis ingénieure dans l’unité MIA MaIAGE

Frédéric Toppan, unité Ingenum, Gestionnaire d’unité

Thierry Caquet, CD EFPA puis directeur scientifique environnement (responsable scientifique du Cati SIOEA, impliqué dans les Cati CGI et IUMA)

Hervé Monod, CD MIA (implication dans plusieurs Cati, notamment thématiques « omiques », modélisation et calcul)

Sylvie Dequin, CD MICA (implication dans le Cati MIAGO)

Stéphane Ingrand CDA Phase (responsable scientifique du Cati SICPA)

Jean Michel Perez-Cano, Directeur des Systèmes d’information (responsable du Cati ICARE) – puis relais de Françoise Roudaut –

Sylvie Ladet, unité Dynafor département SAD (responsable opérationnel du Cati Action depuis 2009).

Anne Goelzer, unité MaIAGE, département MIA (responsable opérationnel du Cati MIAGO)

Les étapes pour l’homologation

Les principales étapes de travail de la commission ont été les suivantes :

26 avril 2017 : 1re journée de travail de la commission, Paris (bilan Catis 2012)

11 Juillet 2017 : 2e journée de travail de la commission, Paris (principes de construction des Catis 3G)

3 Octobre 2017 : Réunion avec les Chefs de départements sur les Catis

9 Octobre 2017 : Assemblée générale « Inter Catis 2G » et ateliers de travail pilotés par la commission Catis 3G

29 Janvier 2018 : 3e journée de travail de la commission, Paris (phasage avec le SDN)

30 Mas 2018 : Journée de présentation et d’échanges de la commission avec les porteurs potentiels de Catis 3G et annonce de lancement de l’appel à manifestation d’intérêt (AMI)

Mai 2018 : Réception des réponses à l’appel à manifestation d’intérêt pour les Catis 3G

31 Mai : 4e journée de travail de la commission, Paris (analyse des réponses à l’appel à manifestation d’intérêt)

Juin 2018 : Diffusion de la synthèse et des préconisations de la commission sur les appels à manifestation d’intérêt pour les Catis 3G

Septembre 2018 : Réception des dossiers d’homologation pour les Catis 3G

3 Octobre 2018 : 5e journée de travail de la commission, Paris (analyse des dossiers d’homologation)

Octobre 2018 : Synthèse et recommandations sur les dossiers d’homologation pour les Catis 3G

La commission d’homologation a opéré en 2 phases, l’appel à manifestation d’intérêt et l’homologation des projets finaux. La première phase a abouti à 21 manifestations d’intérêt. A l’issue de l’analyse de celles-ci, la commission a proposé d’aller vers des regroupements, fusions, et reconfigurations plus fortes et les plus cohérentes possibles de plusieurs projets de Catis, aboutissant potentiellement à des Catis de plus grande taille partageant des questions transversales communes. Pour la seconde phase, la commission d’homologation a reçu 18 projets finaux, soit un peu moins qu’en 2012 (21 Catis avaient été homologués, dont 18 scientifiques). Un travail « en amont », conduit par les départements (et dans bien des cas, en inter départements) et par les directions d’appui, en lien avec les Catis, a été nécessaire pour construire des Catis ayant un réel adossement à une orientation scientifique ou d’appui assumé.

Les documents à télécharger

Appel à Manifestation d'Intérêt : version Word et PDF

Analyse de la commission d'homologation CATI 3G sur les AMI : Avis.pdf

Ensemble des dossiers de réponse à l'AMI : AMI2018_CATI3G

Dossier définitif : version Word et PDF tableau annexe : Excel

Ensemble des dossiers de demande d'homologation : CATI3G_dossiers

Avis définitif de la commission d'homologation : Synthese_et_analyse_sur_les_dossiers_complets_pour_les_CATI_3G.pdf