communaute:sapi:sapis2026

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 **COMPOSITION DE L’ÉQUIPE RESPONSABLE** : **COMPOSITION DE L’ÉQUIPE RESPONSABLE** :
  
-  * Confais Johann, GREP (3G) GIPSci (4G), johann.confais@inrae.fr +  * Confais Johann, GREP (3G) GIPSci (4G) 
-  * Kreplak Jonathan, GREP (3G) GIPSci (4G), jonathan.kreplak@inrae.fr +  * Kreplak Jonathan, GREP (3G) GIPSci (4G) 
-  * Elbelt Sonia, PlantBreed (3G) GIPSci (4G), sonia.elbelt@inrae.fr +  * Elbelt Sonia, PlantBreed (3G) GIPSci (4G) 
-  * Lasserre-Zuber Pauline, BARIC, pauline.lasserre-zuber@inrae.fr +  * Lasserre-Zuber Pauline, BARIC 
-  * Duvaux, Ludovic, BIOS4Biol, ludovic.duvaux@inrae.fr+  * Duvaux, Ludovic, BIOS4Biol
  
 **TYPE DE PROJET** :  **TYPE DE PROJET** : 
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 panREPET a été initialement développé pour annoter les éléments transposables dans les pangénomes, à partir de génomes modèles de petite taille. Aujourd’hui, plusieurs équipes d’INRAE travaillant sur des génomes de grande taille souhaitent l’exploiter, ce qui nécessite une adaptation de l’outil à la montée en charge. Le projet a ainsi pour objectif d’améliorer la robustesse, l’interopérabilité et les performances de panREPET ainsi que le développement d’outils de visualisation, d’une documentation complète et d’actions de formation pour la communauté panREPET a été initialement développé pour annoter les éléments transposables dans les pangénomes, à partir de génomes modèles de petite taille. Aujourd’hui, plusieurs équipes d’INRAE travaillant sur des génomes de grande taille souhaitent l’exploiter, ce qui nécessite une adaptation de l’outil à la montée en charge. Le projet a ainsi pour objectif d’améliorer la robustesse, l’interopérabilité et les performances de panREPET ainsi que le développement d’outils de visualisation, d’une documentation complète et d’actions de formation pour la communauté
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 [[./sapi::sapis2026::All4PanTEs| Page du projet All4PanTEs]] [[./sapi::sapis2026::All4PanTEs| Page du projet All4PanTEs]]
  
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 +==== Projet  ComparTax ====
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 +**Description** :  Évaluation de méthodes permettant la comparaison de bases de données taxonomiques et de séquences pour l’analyse d’écosystèmes microbiens
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 +**PORTEURS** :
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 +BERNARD Maria et RUÉ Olivier
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 +**CATI/PEPI (porteur)**: BIOS4Biol (-> B4B) ; OR : BOOM PEPI IBIS 
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 +**COMPOSITION DE L’ÉQUIPE RESPONSABLE** :
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 +  * Maria Bernard - CATI B4B
 +  * Olivier Rué - CATI BOOM
 +  * Maxime Courcelle - CATI BOOM
 +  * Joseph Tran - CATI BARIC
 +  * Kévin Gazengel - CATI BARIC
 +  * Samuel Mondy - CATI BARIC
 +  * Géraldine Pascal - CATI B4B
 +  * Gabryelle Agoutin - CATI B4B
 +  * Lucas Auer - CATI B4B
 +  * Etienne Rifa - CATI B4B
 +  * Benjamin Linard – UR MathNum
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 +**TYPE DE PROJET** : projet pilote (POC)
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 +**RÉSUMÉ DU PROJET** :  
 +La comparaison des études sur les écosystèmes microbiens se heurte aujourd'hui à un verrou majeur : l'hétérogénéité et l'instabilité des référentiels taxonomiques. Pour lever cet obstacle, le projet ComparTax vise à identifier et tester des méthodes de réconciliation capables de quantifier la convergence entre bases de données divergentes. En établissant un cadre d'évaluation normé et une méthodologie de test standardisée, ce projet fournira les bases nécessaires permettant d’avancer vers une véritable interopérabilité des études en écologie microbienne.
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 +[[./sapi::sapis2026::ComparTax| Page du projet ComparTax]]
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 +==== Projet  DevSecOps & Cloud ====
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 +**Description** :  Animation d’une communauté transverse sur les thématiques du cloud et du DevSecOps, et organisation de hackathons thématiques
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 +**PORTEURS** :
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 +Hervé Toureille
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 +**CATI/PEPI (porteur)**: SoNET (3G), CATI DevSecOps & Cloud (4G) 
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 +**COMPOSITION DE L’ÉQUIPE RESPONSABLE** :
 +  * Hervé Toureille CATI DevSecOps
 +  * Aurélien Perillat-Bottonet CATI DevSecOps
 +  * Ludovic Castagnedoli CATI DevSecOps
 +  * Gilian Gambini CATI DevSecOps
 +  * Antoine SCHELLENBERGER CATI DevSecOps
 +  * Jean-François Rey CATI DevSecOps
 +  * Martin Souchal CATI DevSecOps
 +  * Estelle Ancelet CATI DevSecOps
 +  * Raphaël Flores CATI GIPSci
 +  * Jacques Lagnel CATI GIPSci
 +  * Eric Maldonado CATI Micado
 +  * Stéphane Paris CATI Micado
 +  * Olivier Schneider CATI IngeLo
 +  * François Cedelle CATI IngeLo
 +  * François Laperruque CATI SICGPAE
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 +**TYPE DE PROJET** : Animation d’une communauté transverse 
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 +**RÉSUMÉ DU PROJET** :  
 +Le SAPI "DevSecOps & Cloud" a pour mission d'accompagner les équipes de l'organisation dans leur transition vers des pratiques modernes d'infrastructure, de développement et de gestion des applications, notamment en environnement cloud. Notre objectif est de poursuivre la construction d’une communauté active et collaborative autour des technologies cloud et DevSecOps,. En complément du CATI éponyme, le SAPI « DevSecOps & cloud » servira de support pour proposer des activités transverses avec les CATI de l’institut, notamment en proposant l’organisation d’un hackathon en présentiel.
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 +[[https://devsecops.pages-forge.inrae.fr/web/| Page du projet  DevSecOps & Cloud]]
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 +==== Projet  E-MOV ====
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 +**Description** : E-MOV : Échanges sur la modélisation sémantique des Mesures, Observations et Variables dans les SI INRAE
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 +**PORTEURS** :
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 +Fabrice Legeai
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 +**CATI/PEPI (porteur)**: BARIC
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 +**COMPOSITION DE L’ÉQUIPE RESPONSABLE** :
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 +  * Hélène Chiapello, MICA, CATI BOOM
 +  * Julien Cufi, TRANSFORM, CATI DIISCICO
 +  * Fabrice Legeai, SPE, CATI BARIC
 +  * Christian Pichot, RDS ECODIV, CATI GEDEOP
 +  * Virginie Rossard, AGROECOSYSTEM, CATI CODEX
 +  * Magalie Weber, TRANSFORM, CATI DIISCICO
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 +**TYPE DE PROJET** : projet structurant (création ou animation d’une communauté, liens entre CATIs, etc)
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 +**RÉSUMÉ DU PROJET** :  
 +Plusieurs importantes bases de données et systèmes d’information de l’Institut, dont l’instance Envi-BIS [1] d’OpenSILEX, PO2, BaGaTel [2], SI AnaEE [3] utilisent un modèle générique pour structurer les mesures ou les observations et les données qui leur sont associées, basé sur les ontologies SOSA ou OBOE et I-ADOPT. Nous proposons d’échanger autour de la construction des schémas conceptuels de données à l’aide de ces ontologies, afin de faire un bilan critique des implémentations, de mutualiser les outils pour manipuler les données et de proposer un tutoriel et des recommandations pour aider la conception de nouveaux Systèmes d’Information interopérables et/ou faciliter l’interrogation des SI existants.
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 +[[./sapi::sapis2026::E-MOV| Page du projet E-MOV]]
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 +==== Projet INRAgilE ====
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 +**Description** : Création et animation d’une communauté autour de l’Agilité
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 +**PORTEURS** :
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 +MarieLN Moirez-Charron
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 +**CATI/PEPI (porteur)**: La Communauté PEPI
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 +**COMPOSITION DE L’ÉQUIPE RESPONSABLE** :
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 +  * MarieLN Moirez-Charron
 +  * Alexandre Journaux
 +  * Sophie Normant
 +  * Stéphane Gatine
 +  * Audrey Palain - Saint - Agathe
 +  * Jacques Lagnel
 +  * Olivier Filangi
 +  * Virginie Rossard
 +  * Jean-François Rey
 +  * Tovo Rabemanantsoa
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 +**TYPE DE PROJET** : Création et animation d’une communauté autour de l’Agilité
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 +**RÉSUMÉ DU PROJET** :  
 +Ce projet vise à créer une communauté INRAE composée de personnes sensibilisées aux méthodes agiles et plus largement aux bonnes pratiques de pilotage de projets. L’objectif est de favoriser un cadre d’échanges autour de la conduite de projets, de l’organisation du travail en équipe, et de l’amélioration continue. Cette communauté permettra de partager sur les pratiques, sur l’utilisation d’outils, sur des retours d’expérience, sur de la veille, ... L’organisation d’un séminaire est le point de démarrage de cette communauté. Il permettra d’apprendre à se connaître et à partager des connaissances et un vocabulaire commun.
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 +[[./sapi::sapis2026::INRAgilE| Page du projet INRAgilE]]
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 +==== Projet IOT LoRaWAN ====
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 +**Description** : Préparer la mise en place d’une offre de service IoT LoRaWAN INRAE
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 +**PORTEURS** :
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 +  * Lagnel Jacques
 +  * Langrume Christophe
 +  * Bompa Jean-François
 +  * Catala Pierre
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 +**CATI/PEPI (porteur)**: La Communauté PEPI
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 +**COMPOSITION DE L’ÉQUIPE RESPONSABLE** :
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 +  * Jacques Lagnel GIPSci
 +  * Jean-François Bompa SICGPAE
 +  * Christophe Langrume DIISCICO /Pépinière Numérique
 +  * Pierre Catala DevSecOps
 +  * François Laperruque SICGPAE
 +  * Cédric Goby DevSecOps
 +  * Guillaume Delosières SICGPAE 
 +  * Sophie Normant SICGPAE 
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 +**TYPE DE PROJET** : Projet structurant (création ou animation d’une communauté)
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 +**RÉSUMÉ DU PROJET** :  
 +À la suite du projet SaPIs 2023, face à l’augmentation rapide des besoins des unités de recherche (déjà 6 demandes d’unités formulées), le présent projet vise étudier les conditions et produire les éléments pour la mise en place d’une offre de service IoT LoRaWAN INRAE au moyen de l’accompagnement de 3 sites pilotes débutant sur cette technologie et d’un hackathon d’élaboration des livrables. Il s’agit de passer d’une logique exploratoire à une offre structurée, mutualisée et durable, intégrant gouvernance et rôles des acteurs. Les livrables de ce projet sous la forme de documentations viseront à décrire l’organisation et son fonctionnement, ainsi qu’harmoniser les pratiques et faire monter en compétences les entités devant faire de l’acquisition de données sur le terrain via la technologie LoRaWAN.
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 +[[./sapi::sapis2026::IOT LoRaWAN| Page du projet IOT LoRaWAN]]
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 +==== Projet MICROBIOMESCHEMA 2.0 ====
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 +**Description** : MicroBiomeSchemas 2.0 : des schémas de métadonnées partagés pour les données métaomiques des projets ciblant des microbiomes d’intérêt étudiés à INRAE
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 +**PORTEURS** :
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 +  * CHIAPELLO Hélène
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 +**CATI/PEPI (porteur)**: CATI BOOM
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 +**COMPOSITION DE L’ÉQUIPE RESPONSABLE** :
 +  * Hélène Chiapello, CATI BOOM, dept MICA
 +  * Magalie Weber CATI DIISCICO, dept TRANSFORM
 +  * Fabrice Legeai, CATI BARIC, dept SPE
 +  * Jonathan Mineau, CATI GEDEOP, DipSO
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 +**TYPE DE PROJET** : Projet structurant  & projet pilote
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 +**RÉSUMÉ DU PROJET** :  
 +Le projet MicroBiomeSchemas 2.0 vise à continuer la construction et le partage de schémas  standardisés de métadonnées permettant de caractériser les données métaomiques de microbiomes étudiés à l'INRAE (aliments, holobiontes de plantes et animaux, microbiote humain, digesteurs). Le projet est dans la continuité du projet MicrobiomeSchemas Sapi 2025 qui a conduit à deux nouveaux projets en 2026 : E-MOV (Echanges sur les Mesures Observations et Variables) et MicrobiomeSchemas 2.0. Les deux projets fonctionneront de manière coordonnée et visent à assurer l’interopérabilité et la réutilisabilité des données, l’un sous l’angle de la généricité d’un schéma conceptuel (E-MOV) et l’autre sous l’angle des métadonnées (MicrobiomeSchemas 2.0)
  
  
 +[[./sapi::sapis2026::MICROBIOMESCHEMA 2.0| Page du projet MICROBIOMESCHEMA 2.0]]
  
  
  • communaute/sapi/sapis2026.1773043339.txt.gz
  • Dernière modification : 2026/03/09 09:02
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