communaute:sapi:sapis2024

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 L’objectif pour 2024 est d’organiser de nouveaux ateliers pour la co-conception de solutions innovantes pour le traitement, l’analyse, l’intégration de données omiques. L’objectif pour 2024 est d’organiser de nouveaux ateliers pour la co-conception de solutions innovantes pour le traitement, l’analyse, l’intégration de données omiques.
  
 +**PRODUCTION DU PROJET** : 
 +
 +https://forgemia.inra.fr/inter_cati_omics/hackathon_inter_cati_2024_sete/-/tree/main
 ==== Projet INRAgilE ==== ==== Projet INRAgilE ====
  
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 Tester et implémenter des solutions pour produire, décrire et manipuler des graphes de pangénomes et les annotations associées (gènes et éléments transposables). Un attendu fort est de permettre l’intégration d’annotations issues d’outils complémentaires dans les approches pangénomiques (ex PanREPET pour les TE). Il s’agit de développer des services automatisés, pour stocker et décrire les données sources, déclencher automatiquement des traitements (workflows) par intégration continue. Le projet permettra de consolider un collectif qui a été initié dans des actions précédentes et souhaite se renforcer pour mutualiser son travail et monter en compétence. Tester et implémenter des solutions pour produire, décrire et manipuler des graphes de pangénomes et les annotations associées (gènes et éléments transposables). Un attendu fort est de permettre l’intégration d’annotations issues d’outils complémentaires dans les approches pangénomiques (ex PanREPET pour les TE). Il s’agit de développer des services automatisés, pour stocker et décrire les données sources, déclencher automatiquement des traitements (workflows) par intégration continue. Le projet permettra de consolider un collectif qui a été initié dans des actions précédentes et souhaite se renforcer pour mutualiser son travail et monter en compétence.
 +
 +**PRODUCTION DU PROJET** : 
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 +https://forgemia.inra.fr/panannot
 +
  
 ==== Projet SHARE-OMICS ==== ==== Projet SHARE-OMICS ====
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 Le projet SK8 propose un service d’hébergement d’applications R-Shiny avec les outils et les infrastructures mises à disposition dans l’institut INRAE. Le projet est en fin de phase 2 (consolidation et pérennisation) et souhaiterait fédérer ses utilisateurs en organisant une journée annuelle pour les utilisateurs du service (comité des utilisateurs). Le projet SK8 propose un service d’hébergement d’applications R-Shiny avec les outils et les infrastructures mises à disposition dans l’institut INRAE. Le projet est en fin de phase 2 (consolidation et pérennisation) et souhaiterait fédérer ses utilisateurs en organisant une journée annuelle pour les utilisateurs du service (comité des utilisateurs).
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 +Site du projet SK8 : [[https://sk8.inrae.fr/]]
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 +Site de la journée à destination de ses utilisateurs : [[https://sk8.pages.mia.inra.fr/journee_shiny_inrae/edition_2025/]]
  
 ==== Projet WebSemPilot ==== ==== Projet WebSemPilot ====
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  • Dernière modification : 2024/01/31 09:54
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